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TMT定量蛋白質組學
作者：admin2022-06-13 09:38
熱度：199
實驗介紹
TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研發的一種多肽體外等重同位素標記的相對與絕對定量技術，采用6、10及16種同位素的標簽，通過特異性標記多肽的氨基基團，經高分辨質譜儀串聯分析，可同時比較多達16種樣品之間的蛋白質表達量，是定量蛋白質組學中經典的高通量篩選技術
應用方向
生物領域各個研究方面，如：
? 農林領域：抗逆脅迫機制，生長發育機制，育種保護研究等
? 畜牧業：肉類及乳品質研究，致病機理研究等
? 基礎醫學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
? 生物醫藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發等
? 微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產：漁業資源，海水養殖，漁業環境與水產品安全等
? 生物能源、環境科學領域：發酵過程優化，生物燃料生產，環境危定風險評估研究等
? 食品營養：食品儲藏及加工條件優化，食品組分及品質鑒定，功能性食品開發，食品安全監檢測等
數據分析
標準數據分析內容 | |
蛋白質總鑒定數量分析 | 蛋定與定量結果統計、差異結果統計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質功能分析 | 亞細胞定位、結構域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網絡分析 |
質量控制分析 | 肽段離子質量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質豐度比分布 |
高級數據分析內容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關聯的核心蛋白質 |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質的表達趨勢模式 |
技術優勢
? 同一批次標記的樣本統一處理，減少樣本處理及實驗誤差，實驗平行性較高
? 同一批次標記定量穩定性高
? 通過分級方法可深度可大大增加蛋白鑒定深度