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IF:12.4,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)+轉(zhuǎn)錄組+機(jī)制實(shí)驗(yàn),解析隱丹參酮防止腹主動脈瘤形成!

題目:通過隱丹參酮靶向平滑肌細(xì)胞Keap1-Nrf2-GSDMD-焦亡軸可防止腹主動脈瘤形成

英文名:Targeting the smooth muscle cell Keap1-Nrf2-GSDMD-pyroptosis axis by cryptotanshinone prevents abdominal aortic aneurysm formation

雜志:THERANOSTICS

影響因子:12.4

發(fā)表時間:2024年10月07

研究背景:腹主動脈瘤(AAA)是一種炎癥性、致命的主動脈疾病,目前缺乏任何有效的藥物。隱丹參酮(CTS)是一種突出且廉價的生物活性物質(zhì),來源于丹參Bunge,這是一種眾所周知的草藥,通過其強(qiáng)大的抗炎特性治療心血管疾病。然而,CTS對AAA形成的治療效果仍然未知。

研究思路:為探討CTS對AAA的治療效果,采用多種實(shí)驗(yàn)方法,主要包括AAA小鼠模型建立、實(shí)時聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)、RNA測序、蛋白質(zhì)印跡、免疫共沉淀、掃描/透射電子顯微鏡(SEM/TEM)、酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA)、seahorse分析、免疫組化和共聚焦成像。在這項(xiàng)研究中,作者證明CTS抑制了輸注AngII的載脂蛋白E敲除(ApoE-/-)小鼠中AAA的形成。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和轉(zhuǎn)錄組測序分析的結(jié)合表明,血管平滑肌細(xì)胞(VSMC)中Keap1-Nrf2通路的激活和程序性細(xì)胞死亡的調(diào)節(jié)與CTS的抗AAA作用密切相關(guān)。利用分子對接,結(jié)合細(xì)胞熱位移測定(CETSA)和等溫滴定量熱法(ITC),在CTS和Keap1之間的Arg415位點(diǎn)建立了一個特定的結(jié)合位點(diǎn)。

研究結(jié)果:

1、CTS抑制AngII誘導(dǎo)的ApoE-/- 小鼠AAA形成

使用了AngII誘導(dǎo)的小鼠AAA模型,十二周大的雄性ApoE-/-小鼠在AngII輸注當(dāng)天每天給予低劑量或高劑量的CTS(CTS-L或CTS-H)或載體(圖1A)。在實(shí)驗(yàn)終點(diǎn),AngII輸注組的收縮壓高于生理鹽水組,無論是否使用CTS治療都沒有顯著差異(圖1B)。高劑量的CTS顯著提高了小鼠AAA模型中的存活率(圖1C-D)。相比之下,CTS-L組只有46.7%(7/15)的小鼠和CTS-H組只有26.7%(4/15)的小鼠出現(xiàn)了AAA(圖1D)。還觀察到CTS治療后maximum腹主動脈直徑顯著降低(圖1E-F)。

圖1

H&E和EVG染色表明CTS大大減輕了彈性蛋白的損傷和惡化(圖1G-I)。此外,CTS治療導(dǎo)致劑量依賴性相當(dāng)大且陽性區(qū)域較?。▓D1J)。AngII灌注小鼠主動脈中層的VSMCs與生理鹽水對照小鼠相比,α-SMA和SM22α水平顯著下降,而CTS有效地挽救了α-SMA和SM22α的下降(圖1J-L)。CTS處理小鼠主動脈中的MMP活性顯著降低(圖1M-N)。這些結(jié)果表明CTS阻礙AAA的形成,并維持血管平滑肌細(xì)胞穩(wěn)態(tài)AngII誘導(dǎo)小鼠AAA模型。

2、CTS在體外AAA模型中協(xié)調(diào)VSMC表型、炎癥、氧化應(yīng)激和線粒體功能

CTS劑量依賴性地抑制了TNF-α誘導(dǎo)的血管細(xì)胞粘附分子-1(VCAM-1)和基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP2、3和9)的蛋白表達(dá),這在RAVSMCs(圖2A)和MAVSMCs中起著關(guān)鍵作用。如圖2B所示,CTS以劑量相關(guān)的方式增加彈性蛋白表達(dá),同時防止TNF-α-誘導(dǎo)的RAVSMCs和MAVSMCs中SMC收縮表型標(biāo)志物SM22α和α-SMA表達(dá)的減少。通過DHE染色和流式細(xì)胞術(shù)評估的ROS水平在TNF-α或AngII處理中顯著升高,而CTS有效地抑制了這種升高(圖2C-H)。因此,抗氧化劑超氧化物歧化酶(SOD)水平和ATP水平降低,而在TNF-α暴露的VSMCs和AngII處理的小鼠血清中,氧化應(yīng)激指標(biāo)丙二醛(MDA)水平升高,CTS阻止了這種影響(圖2I-L)。CTS處理減少了細(xì)胞培養(yǎng)上清液中的LDH釋放(圖2M)。CTS處理后,細(xì)胞表現(xiàn)出接近正常的形態(tài),沒有明顯的超微結(jié)構(gòu)損傷(圖2N)。此外,TNF-α處理誘導(dǎo)VSMCs的耗氧率(OCR)和細(xì)胞外酸化率(ECAR)顯著增加,而CTS處理有效地逆轉(zhuǎn)了TNF-α誘導(dǎo)的線粒體功能障礙和糖酵解增加(圖2O-P)。將VSMCs暴露于TNF-α?xí)?dǎo)致細(xì)胞質(zhì)dsDNA和mtDNA數(shù)量的增加,而CTS處理逆轉(zhuǎn)了這種影響(圖2Q-R)。

總體而言,這些發(fā)現(xiàn)表明CTS抑制VSMC炎癥、ROS產(chǎn)生和線粒體損傷,從而在TNFα誘導(dǎo)的AAA 體外模型中維持VSMC穩(wěn)態(tài)。

圖2

3、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合RNA-seq分析表明,CTS激活Keap1-Nrf2-HO-1通路并抑制細(xì)胞死亡通路

為了繪制AAA中CTS交互目標(biāo)的全局地圖,使用了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(圖3Aa-b)。在這個集中的網(wǎng)絡(luò)中,以黃色標(biāo)記的十個目標(biāo)在AAA中至關(guān)重要,并且已被證明與AAA的進(jìn)展密切相關(guān),特別是Keap1-Nrf2-HO-1信號軸(圖3Ac-d)。

圖3

CTS主要富集的途徑集中在炎癥反應(yīng)和細(xì)胞死亡的類別上(圖3B)?;鹕綀D顯示,當(dāng)暴露于CTS時,由轉(zhuǎn)錄因子Nrf2調(diào)節(jié)的靶基因增加,與其他基因相比,Hmox-1(HO-1的基因名稱)表現(xiàn)出最顯著的上調(diào)(圖3C)。熱圖顯示與載體組相比,CTS實(shí)驗(yàn)組中Nrf2靶基因的高轉(zhuǎn)錄(圖3D)。此外,差異表達(dá)基因的KEGG分析表明,CTS對炎癥和細(xì)胞死亡途徑的調(diào)節(jié)有顯著影響,與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)現(xiàn)一致(圖3E)。在GO富集分析中,很明顯CTS對“Keap1-Nrf2途徑”產(chǎn)生了影響,與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的結(jié)果一致(圖3F)。

4、CTS激活Keap1-Nrf2-HO-1通路并抑制VSMC中的焦亡通路以預(yù)防AAA

根據(jù)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和RNA-seq的發(fā)現(xiàn),CTS治療在體內(nèi)誘導(dǎo)了AngII灌注小鼠主動脈介質(zhì)中VSMCs中Nrf2和HO-1的穩(wěn)健蛋白表達(dá)(圖4A-B)。進(jìn)一步分析CTS對體外培養(yǎng)的VSMCs的影響,發(fā)現(xiàn)Keap1蛋白表達(dá)減少,Nrf2及其靶蛋白HO-1和NQO1顯著增加(圖4C)。Nrf2蛋白水平在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中均有所增加,其中增加在細(xì)胞核中更為明顯(圖4D)。免疫熒光染色進(jìn)一步證實(shí)了這一點(diǎn)(圖4E),表明Nrf2通路顯著激活。

圖4

RNA-seq數(shù)據(jù)顯示,在TNF-α刺激的VSMCs中,Gsdmd的轉(zhuǎn)錄水平升高,而CTS治療緩解了這種升高(圖5a)。通過蛋白質(zhì)印跡檢測到焦亡途徑中關(guān)鍵靶點(diǎn)的蛋白質(zhì)水平,包括NLRP3、Cle-Caspase1、N-GSDMD、IL-1β和IL-18,并顯示在AngII注入的小鼠主動脈組織或TNF-α處理的RAVSMCs中顯著增加,同時被CTS抑制(圖5B-E)。此外,IHC證實(shí)了小鼠主動脈橫截面中NLRP3、Caspase1和GSDMD的表達(dá)(圖5F-G),ELISA測定證實(shí)了小鼠血清中IL-1β、IL-18和其他兩種關(guān)鍵的AAA相關(guān)細(xì)胞因子(TNF-α和IL-6)的釋放(圖5H)。最后,用相差顯微鏡和掃描電鏡觀察焦亡的形態(tài)學(xué)變化。在相差顯微鏡下,細(xì)胞呈現(xiàn)氣球狀形態(tài)。此外,SEM觀察到VSMCs在TNF-α刺激下細(xì)胞大小腫脹和細(xì)胞膜上形成孔隙的明顯跡象,而CTS治療改善了異常形態(tài)學(xué)(圖5I-J)。

圖5

5、CTS直接結(jié)合Keap1的Arg415殘基激活Nrf2通路,改善氧化應(yīng)激和炎癥

使用CETSA、分子對接分析和ITC來確定CTS和Keap1之間是否存在直接接觸。測定表明CTS對增加Keap1的熱穩(wěn)定性有實(shí)質(zhì)性影響,Tm50為11.68°C(圖6A)。此外,ITDRF-CETSA測定提供了進(jìn)一步的證據(jù),證明了IC50為2μM的CTS對Keap1蛋白的劑量依賴性結(jié)合和顯著穩(wěn)定(圖6B)。分子對接分析顯示CTS對Keap1的Arg415(R415)殘基具有highest的親和力(圖6C)。Keap1R415K蛋白與CTS的熱穩(wěn)定性顯著下降,與Keap1WT蛋白相比,Tm50值為7.41°C(圖6D)。CTS對Keap1WT蛋白表現(xiàn)出更高的結(jié)合親和力,而對突變的Keap1沒有觀察到明顯的結(jié)合(圖6E-F)。此外,Co-IP測定顯示CTS治療顯著降低了Keap1蛋白水平與VSMCs中的Nrf2結(jié)合(圖6G)。還觀察到CTS處理后Nrf2的泛素化水平降低(圖6H)。這些發(fā)現(xiàn)表明CTS直接與Keap1中的Arg415殘基相互作用,從而阻礙Keap1和Nrf2之間的結(jié)合,阻止Nrf2泛素化和隨后的降解,導(dǎo)致Nrf2逃逸和易位到細(xì)胞核以開始細(xì)胞保護(hù)基因的轉(zhuǎn)錄。

圖6

DHE染色和流式細(xì)胞儀顯示,在轉(zhuǎn)染Keap1-WT的VSMCs中,CTS處理后ROS水平顯著提高,但在Keap-R415K轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中沒有(圖7A-B)。此外,將Keap1R415K轉(zhuǎn)染VSMCs顯著抑制CTS誘導(dǎo)的Nrf2和HO-1蛋白表達(dá)上調(diào)(圖7C-D)。此外,Western blot表明,CTS在轉(zhuǎn)染Keap1WT的VSMCs中具有抗炎和抗焦亡作用,但在Keap1R415K中沒有(圖7C-D)??傊?,CTS與Keap1中415位點(diǎn)氨基酸的結(jié)合對改善至關(guān)重要。

圖7

6、在體外 AAA模型中,抑制Keap1-Nrf2通路可逆轉(zhuǎn)CTS的保護(hù)作用

在ML385存在的情況下,CTS對MMPs(MMP2、3和9)以及VCAM-1蛋白水平的消除被完全消除(圖8A)。觀察到MMPs和AAA相關(guān)細(xì)胞因子(Il1b、Il6和Ccl2)的mRNA水平的類似結(jié)果(圖8B)。此外,ML385部分損害了CTS恢復(fù)彈性蛋白和SMC收縮表型標(biāo)志物(SM22α和α-SMA)蛋白水平的能力(圖8C)。ML385處理也逆轉(zhuǎn)了CTS介導(dǎo)的抗氧化能力,如使用流式細(xì)胞術(shù)(圖8D-E)和DHE染色檢測ROS水平所示(圖8F-G)此外,CTS對NLRP3-Cle-Caspase1-N-GSDMD介導(dǎo)的焦亡的抑制作用通過ML385給藥被廢除(圖8H)。總之,這些結(jié)果表明,CTS通過激活Nrf2在體外模型中在AAA中維持VSMC穩(wěn)態(tài)并抑制VSMC焦亡。

圖8

7、VSMC特異性 Nfe2l2 敲低消除了小鼠AAA模型中CTS的保護(hù)作用

熒光成像顯示AAV特異性感染主動脈而不是其他器官(圖 9 A)。小鼠主動脈的橫截面顯示GFP在中層中特異性表達(dá)(圖 9 B)。此外,western blot分析表明,在AAV2病毒存在的情況下,大腦中Nrf2蛋白的表達(dá)是一致的,而主動脈明顯降低(圖 9 C)。將病毒注射到ApoE-/-小鼠中,以建立上述AngII誘導(dǎo)的小鼠AAA模型(圖 9 D)。正如預(yù)期的那樣,觀察到CTS有效抑制了AngII注入的ApoE-/- 小鼠的AAA形成。有趣的是,當(dāng)Nrf2在小鼠VSMC中沉默時,抑制作用減弱,如AAA發(fā)生率增加、存活率降低和腹主動脈maximum直徑增加所示(圖 9 E-H)。此外,組織學(xué)評估描述了Nrf2缺陷與CTS治療效果受損之間的直接聯(lián)系。這表現(xiàn)為顯著的外膜增厚、彈性蛋白碎裂增加以及主動脈內(nèi)層內(nèi)膠原含量的顯著降低(圖 9 I-J)。免疫組織化學(xué)分析證實(shí)了這些發(fā)現(xiàn),表明AAV介導(dǎo)的shNfe2l2 有效抑制了CTS誘導(dǎo)的VSMC中Nrf2的穩(wěn)定和激活(圖 9 K)。進(jìn)一步的免疫熒光研究表明,CTS給藥顯著上調(diào)了VSMC中的Nrf2表達(dá)。使用AAV-shNfe2l2 阻礙了這種上調(diào),同時導(dǎo)致α-SMA蛋白水平降低(圖 9 L)。通過ELISA檢測細(xì)胞因子,包括IL-1β、IL-6、IL-18和TNF-α,結(jié)果顯示與AngII輸注小鼠相比,CTS處理的小鼠明顯減少。然而,CTS的治療效果在很大程度上被Nrf2敲低所抵消(圖 9 M)。

圖9

此外,免疫組織化學(xué)染色顯示,VSMCs中的Nrf2敲低通過增加炎癥、促進(jìn)VSMC表型轉(zhuǎn)換和提高M(jìn)MP水平來阻斷CTS的治療效果。盡管CTS治療可以通過激活Nrf2介導(dǎo)的通路和彈性蛋白水平來改善AAA,但還是觀察到了這一點(diǎn)(圖 10 A),突出了Nrf2是AAA治療的關(guān)鍵治療靶點(diǎn)。Western blot分析進(jìn)一步證明,Nrf2敲低大大削弱了Nrf2通路的激活以及NLRP3和焦亡通路的抑制(圖 10 B)。綜上所述,這些數(shù)據(jù)表明CTS通過激活Nrf2介導(dǎo)的抗炎作用和抑制NLRP3-caspase1引發(fā)的細(xì)胞焦亡,在治療AAA方面很有希望。

圖10

總結(jié):本文通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與轉(zhuǎn)錄組測序、分子對接并結(jié)合細(xì)胞熱位移測定(CETSA)和等溫滴定量熱法(ITC)等濕實(shí)驗(yàn),探究隱丹參酮 (CTS)對AAA的治療效果的方式,是個很好的例子。傲星生物深耕生信分析十余載,有豐富的實(shí)驗(yàn)方案、完善的下游驗(yàn)證、機(jī)制研究服務(wù),一對一專屬服務(wù)為您排憂解難,助您輕松應(yīng)對畢業(yè)和晉升!